國(guó)防軍基地(FND基地)與孤島驚魂系列前作中的哨站類似，簡(jiǎn)單說就是一種敵人營(yíng)地，擊敗該區(qū)域中的所有敵人即可占領(lǐng)該基地。如果在不觸發(fā)警報(bào)的情況下占領(lǐng)基地可以獲得更多資源，如果完全沒有被發(fā)現(xiàn)的話就能獲得最高獎(jiǎng)勵(lì)。
與國(guó)防軍基地相關(guān)的獎(jiǎng)杯有：
【銅】游擊忍者(于單人戰(zhàn)役中在不被發(fā)現(xiàn)的情況下占領(lǐng)一座國(guó)防軍基地)。
【銅】相互依賴(在多人合作中，與一名伙伴共同占領(lǐng)一座國(guó)防軍基地)。
【金】在單人戰(zhàn)役中占領(lǐng)所有國(guó)防軍基地。
不用擔(dān)心漏掉任何一個(gè)國(guó)防軍基地，通關(guān)主線后依然可以返回任意區(qū)域并完成任何內(nèi)容，但容易錯(cuò)過的是與國(guó)防軍基地相關(guān)的獎(jiǎng)杯，因?yàn)閲?guó)防軍基地在被占領(lǐng)后是無法重置的，因此一定要注意獎(jiǎng)杯的解鎖條件。如果不小心在占領(lǐng)所有國(guó)防軍基地后漏掉了相關(guān)獎(jiǎng)杯的話，也不必?fù)?dān)心，可以加入朋友的游戲在合作模式下解鎖漏掉的獎(jiǎng)杯。
以下是全部全FND基地的地圖位置：
圣所島
國(guó)防軍基地-1
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